Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRCH2Q5VUJ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRCH2Q5VUJ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRCH2Q5VUJ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms