Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACHD1Q5VU97 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACHD1Q5VU97 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACHD1Q5VU97 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms