Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF220Q5VTB9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF220Q5VTB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF220Q5VTB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms