Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP350Q5VT06 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CEP350Q5VT06 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP350Q5VT06 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP350Q5VT06 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms