Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDGFL1Q5TGJ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDGFL1Q5TGJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDGFL1Q5TGJ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms