Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM240Q5SV17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM240Q5SV17 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM240Q5SV17 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms