Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC38Q5R3I4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC38Q5R3I4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC38Q5R3I4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms