Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SPECC1Q5M775 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPECC1Q5M775 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms