Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XKR3Q5GH77 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XKR3Q5GH77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms