Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1BQ53T94 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1BQ53T94 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1BQ53T94 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1BQ53T94 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1BQ53T94 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1BQ53T94 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1BQ53T94 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1BQ53T94 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1BQ53T94 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1BQ53T94 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1BQ53T94 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1BQ53T94 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.3 ms