Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN20Q4JDL3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN20Q4JDL3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN20Q4JDL3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN20Q4JDL3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms