Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSR1Q2NL82 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSR1Q2NL82 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSR1Q2NL82 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms