Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNOP1Q1ED39 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNOP1Q1ED39 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms