Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTL8BQ17RB0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTL8BQ17RB0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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