Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B3Q16720 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B3Q16720 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B3Q16720 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms