Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK7Q16549 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCSK7Q16549 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK7Q16549 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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