Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRY1Q16526 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRY1Q16526 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRY1Q16526 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms