Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD2Q16342 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD2Q16342 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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