Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms