Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A5Q15758 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A5Q15758 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A5Q15758 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms