Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3A1Q15459 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3A1Q15459 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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