Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDGFRLQ15198 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFRLQ15198 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRLQ15198 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
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