Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD1Q15116 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCD1Q15116 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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