Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBX1Q14549 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBX1Q14549 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBX1Q14549 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GBX1Q14549 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBX1Q14549 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBX1Q14549 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBX1Q14549 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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