Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAPGEF1Q13905 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF1Q13905 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAPGEF1Q13905 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAPGEF1Q13905 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms