Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOFQ13790 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOFQ13790 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOFQ13790 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOFQ13790 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOFQ13790 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOFQ13790 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOFQ13790 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOFQ13790 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOFQ13790 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOFQ13790 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOFQ13790 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOFQ13790 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOFQ13790 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOFQ13790 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOFQ13790 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOFQ13790 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOFQ13790 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOFQ13790 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOFQ13790 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOFQ13790 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOFQ13790 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOFQ13790 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOFQ13790 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOFQ13790 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOFQ13790 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOFQ13790 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOFQ13790 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOFQ13790 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOFQ13790 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOFQ13790 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOFQ13790 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOFQ13790 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOFQ13790 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOFQ13790 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOFQ13790 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOFQ13790 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOFQ13790 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOFQ13790 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOFQ13790 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOFQ13790 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOFQ13790 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOFQ13790 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOFQ13790 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOFQ13790 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOFQ13790 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOFQ13790 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOFQ13790 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOFQ13790 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOFQ13790 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOFQ13790 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOFQ13790 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOFQ13790 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOFQ13790 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOFQ13790 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOFQ13790 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
APOFQ13790 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOFQ13790 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOFQ13790 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOFQ13790 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOFQ13790 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOFQ13790 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms