Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTM1Q13496 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTM1Q13496 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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