Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL49Q13405 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL49Q13405 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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