Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMS2P3Q13401 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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