Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPA4Q13156 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPA4Q13156 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPA4Q13156 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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