Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFT88Q13099 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFT88Q13099 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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