Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 APE3YBR286W 1614 nt5.92□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 YDL114WYDL114W 927 nt5.92□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 SYN8YAL014C 768 nt5.92□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 MCM3YEL032W 2916 nt5.92□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 GDA1YEL042W 1557 nt5.92□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 ACO1YLR304C 2337 nt5.92□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 YPL277CYPL277C 1464 nt5.91□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 YDR109CYDR109C 2148 nt5.91□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 FAF1YIL019W 1041 nt5.91□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 FRS2YFL022C 1512 nt5.9□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 SNU71YGR013W 1863 nt5.9□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 PRP2YNR011C 2631 nt5.9□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 VTS1YOR359W 1572 nt5.9□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 ARP2YDL029W 1176 nt5.9□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 DUS4YLR405W 1104 nt5.9□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 SMK1YPR054W 1167 nt5.9□□□□□ -1.46
YPQ1Q12010 YCL065WYCL065W 369 nt5.89□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 YRA1YDR381W 681 nt5.89□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 DJP1YIR004W 1299 nt5.89□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 GAT4YIR013C 366 nt5.89□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 MRPL36YBR122C 534 nt5.89□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 NMD5YJR132W 3147 nt5.89□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 GIT1YCR098C 1557 nt5.89□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 PET112YBL080C 1626 nt5.88□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 YDR154CYDR154C 351 nt5.88□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 AMD1YML035C 2433 nt5.88□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 SHM1YBR263W 1473 nt5.88□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 FZF1YGL254W 900 nt5.87□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 RRP46YGR095C 672 nt5.87□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 YLR194CYLR194C 765 nt5.87□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 GLE1YDL207W 1617 nt5.87□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 VRP1YLR337C 2454 nt5.87□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 ORC5YNL261W 1440 nt5.86□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 RMA1YKL132C 1293 nt5.86□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 CAR1YPL111W 1002 nt5.86□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 YEA6YEL006W 1008 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 YFL064CYFL064C 525 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 MLC1YGL106W 450 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 QNS1YHR074W 2145 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 LDB18YLL049W 540 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 SEC13YLR208W 894 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 RRN10YBL025W 438 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 MOD5YOR274W 1287 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 YPR202WYPR202W 717 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 SGE1YPR198W 1632 nt5.85□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 VMA16YHR026W 642 nt5.84□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 APS3YJL024C 585 nt5.84□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 MRPL13YKR006C 795 nt5.84□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 TEA1YOR337W 2280 nt5.84□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 BUD9YGR041W 1644 nt5.84□□□□□ -1.47
YPQ1Q12010 PDR18YNR070W 4002 nt5.83□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 KDX1YKL161C 1302 nt5.83□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 ERG12YMR208W 1332 nt5.83□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 KNH1YDL049C 807 nt5.83□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 GIR2YDR152W 798 nt5.83□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 COG1YGL223C 1254 nt5.83□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YOR389WYOR389W 1875 nt5.82□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YDL057WYDL057W 987 nt5.82□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 MRPL1YDR116C 858 nt5.82□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 CTF8YHR191C 402 nt5.82□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 PNP1YLR209C 936 nt5.82□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.82□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 ATF1YOR377W 1578 nt5.81□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YNR040WYNR040W 771 nt5.81□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YBR124WYBR124W 360 nt5.81□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 KTR3YBR205W 1215 nt5.81□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 NSE5YML023C 1671 nt5.81□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 FET4YMR319C 1659 nt5.81□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 PRP46YPL151C 1356 nt5.8□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 AIM3YBR108W 2844 nt5.8□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SEC20YDR498C 1152 nt5.8□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 LYS12YIL094C 1116 nt5.8□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SPS22YCL048W 1392 nt5.8□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 ATO3YDR384C 828 nt5.79□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YJU3YKL094W 942 nt5.79□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 DAL82YNL314W 768 nt5.79□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 CSG2YBR036C 1233 nt5.79□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 ADE13YLR359W 1449 nt5.79□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YMR155WYMR155W 1644 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 MPA43YNL249C 1629 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YAP1801YHR161C 1914 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 PGK1YCR012W 1251 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 RAD3YER171W 2337 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YGR176WYGR176W 348 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 NPA3YJR072C 1158 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 MEU1YLR017W 1014 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 ERI1YPL096C-A 207 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 IFA38YBR159W 1044 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YML082WYML082W 1950 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 HIS7YBR248C 1659 nt5.78□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 YFR006WYFR006W 1608 nt5.77□□□□□ -1.48
YPQ1Q12010 CHS5YLR330W 2016 nt5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms