Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF415Q09FC8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF415Q09FC8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF415Q09FC8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms