Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF543Q08ER8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF543Q08ER8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF543Q08ER8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF543Q08ER8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms