Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM27E3Q08E93 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM27E3Q08E93 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms