Protein–RNA interactions for Protein: Q08AN1

ZNF616, Zinc finger protein 616, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF616Q08AN1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF616Q08AN1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF616Q08AN1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms