Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC38A11Q08AI6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms