Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD300CQ08708 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD300CQ08708 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms