Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
COL16A1Q07092 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
COL16A1Q07092 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL16A1Q07092 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
COL16A1Q07092 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms