Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EN1Q05925 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EN1Q05925 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EN1Q05925 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EN1Q05925 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
EN1Q05925 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EN1Q05925 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EN1Q05925 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
EN1Q05925 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EN1Q05925 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EN1Q05925 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
EN1Q05925 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EN1Q05925 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EN1Q05925 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EN1Q05925 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EN1Q05925 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EN1Q05925 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
EN1Q05925 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EN1Q05925 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EN1Q05925 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EN1Q05925 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EN1Q05925 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EN1Q05925 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
EN1Q05925 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EN1Q05925 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EN1Q05925 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EN1Q05925 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EN1Q05925 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EN1Q05925 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EN1Q05925 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EN1Q05925 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EN1Q05925 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
EN1Q05925 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EN1Q05925 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EN1Q05925 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
EN1Q05925 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EN1Q05925 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EN1Q05925 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EN1Q05925 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EN1Q05925 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EN1Q05925 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EN1Q05925 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EN1Q05925 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EN1Q05925 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EN1Q05925 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
EN1Q05925 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EN1Q05925 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EN1Q05925 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EN1Q05925 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EN1Q05925 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
EN1Q05925 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EN1Q05925 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EN1Q05925 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EN1Q05925 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EN1Q05925 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EN1Q05925 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EN1Q05925 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EN1Q05925 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EN1Q05925 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EN1Q05925 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EN1Q05925 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EN1Q05925 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EN1Q05925 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EN1Q05925 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EN1Q05925 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EN1Q05925 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EN1Q05925 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EN1Q05925 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EN1Q05925 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EN1Q05925 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EN1Q05925 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EN1Q05925 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EN1Q05925 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EN1Q05925 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EN1Q05925 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EN1Q05925 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EN1Q05925 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EN1Q05925 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
EN1Q05925 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
EN1Q05925 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EN1Q05925 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EN1Q05925 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EN1Q05925 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
EN1Q05925 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EN1Q05925 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EN1Q05925 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EN1Q05925 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EN1Q05925 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EN1Q05925 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EN1Q05925 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EN1Q05925 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EN1Q05925 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EN1Q05925 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
EN1Q05925 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EN1Q05925 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
EN1Q05925 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
EN1Q05925 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
EN1Q05925 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
EN1Q05925 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
EN1Q05925 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms