Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 SCO2YBR024W 906 nt6.78□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 HOS2YGL194C 1359 nt6.78□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 YHL018WYHL018W 363 nt6.77□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 MED4YOR174W 855 nt6.77□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 SCP1YOR367W 603 nt6.77□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YLH47YPR125W 1365 nt6.77□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YEF1YEL041W 1488 nt6.77□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 VHT1YGR065C 1782 nt6.77□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 RBA50YDR527W 1320 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 PAT1YCR077C 2391 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 RPR2YIR015W 435 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YMR295CYMR295C 594 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 GLC8YMR311C 690 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 OCA1YNL099C 717 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 NPT1YOR209C 1290 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 RQC1YDR333C 2172 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 CRZ1YNL027W 2037 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 GLE1YDL207W 1617 nt6.76□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 GLN3YER040W 2193 nt6.75□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 ARP3YJR065C 1350 nt6.75□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 RAD59YDL059C 717 nt6.75□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 AST1YBL069W 1290 nt6.75□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 COQ3YOL096C 939 nt6.75□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 RKI1YOR095C 777 nt6.75□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 PEX3YDR329C 1326 nt6.75□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 AMD2YDR242W 1650 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 GEX1YCL073C 1848 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 CLB4YLR210W 1383 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 UPS3YDR185C 540 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YJR084WYJR084W 1272 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 COX5AYNL052W 462 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 ECM38YLR299W 1983 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 RVB2YPL235W 1416 nt6.74□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 GUP2YPL189W 1830 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 QNS1YHR074W 2145 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YIL055CYIL055C 1884 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 AFG1YEL052W 1530 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 SDH4YDR178W 546 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YDR396WYDR396W 501 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 FPR2YDR519W 408 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YEA6YEL006W 1008 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YLR123CYLR123C 330 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YMR147WYMR147W 672 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 RFA2YNL312W 822 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 PYC2YBR218C 3543 nt6.73□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 CEF1YMR213W 1773 nt6.72□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 RPP1YHR062C 882 nt6.72□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt6.72□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.72□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 HOS1YPR068C 1413 nt6.72□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 BDF2YDL070W 1917 nt6.72□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 PPT1YGR123C 1542 nt6.71□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 CRP1YHR146W 1398 nt6.71□□□□□ -1.33
CEF1Q03654 NSI1YDR026C 1713 nt6.71□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 BUG1YDL099W 1026 nt6.71□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 SPG1YGR236C 288 nt6.71□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 YHR095WYHR095W 495 nt6.71□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 MPM1YJL066C 759 nt6.71□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 SUR7YML052W 909 nt6.71□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 HEM15YOR176W 1182 nt6.71□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 SAC6YDR129C 1929 nt6.71□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 UTR2YEL040W 1404 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 NUP1YOR098C 3231 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 TIM22YDL217C 624 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 GTT3YEL017W 1014 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 HVG1YER039C 750 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 LCB3YJL134W 1230 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 TSR3YOR006C 942 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 FSF1YOR271C 984 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 ERG1YGR175C 1491 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 YDR387CYDR387C 1668 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 RSA4YCR072C 1548 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 DSF1YEL070W 1509 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 YNR073CYNR073C 1509 nt6.7□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 MET7YOR241W 1647 nt6.69□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 APM1YPL259C 1428 nt6.69□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 RTT103YDR289C 1230 nt6.69□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 IPK1YDR315C 846 nt6.69□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 CWC27YPL064C 906 nt6.69□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 YOL036WYOL036W 2286 nt6.69□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 CRF1YDR223W 1404 nt6.68□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 SIR2YDL042C 1689 nt6.68□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 HSP12YFL014W 330 nt6.68□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 QCR8YJL166W 285 nt6.68□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 MTF1YMR228W 1026 nt6.68□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 YNR048WYNR048W 1182 nt6.68□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 SMK1YPR054W 1167 nt6.68□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 SRV2YNL138W 1581 nt6.68□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 FOB1YDR110W 1701 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 RNR3YIL066C 2610 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 MCH1YDL054C 1461 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 UGO1YDR470C 1509 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 ERG7YHR072W 2196 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 RNH201YNL072W 924 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 RPS3YNL178W 723 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 YBR124WYBR124W 360 nt6.67□□□□□ -1.34
CEF1Q03654 UTP6YDR449C 1323 nt6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.6 ms