Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFF2Q03403 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFF2Q03403 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFF2Q03403 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms