Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG1Q02413 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG1Q02413 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms