Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF17Q02223 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF17Q02223 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms