Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMP22Q01453 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms