Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL1Q00532 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL1Q00532 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms