Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFI35P80217 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFI35P80217 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFI35P80217 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFI35P80217 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFI35P80217 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFI35P80217 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFI35P80217 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFI35P80217 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFI35P80217 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFI35P80217 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFI35P80217 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFI35P80217 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFI35P80217 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFI35P80217 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFI35P80217 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFI35P80217 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFI35P80217 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFI35P80217 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFI35P80217 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFI35P80217 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFI35P80217 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFI35P80217 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFI35P80217 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFI35P80217 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IFI35P80217 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFI35P80217 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFI35P80217 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFI35P80217 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFI35P80217 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFI35P80217 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFI35P80217 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFI35P80217 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFI35P80217 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFI35P80217 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFI35P80217 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFI35P80217 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFI35P80217 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFI35P80217 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFI35P80217 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFI35P80217 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFI35P80217 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFI35P80217 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFI35P80217 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFI35P80217 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms