Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC1P78348 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC1P78348 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC1P78348 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms