Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITX1P78337 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITX1P78337 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITX1P78337 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PITX1P78337 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PITX1P78337 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITX1P78337 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITX1P78337 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITX1P78337 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITX1P78337 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITX1P78337 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITX1P78337 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITX1P78337 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITX1P78337 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITX1P78337 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITX1P78337 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX1P78337 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX1P78337 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX1P78337 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX1P78337 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX1P78337 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX1P78337 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX1P78337 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX1P78337 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITX1P78337 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITX1P78337 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITX1P78337 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITX1P78337 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITX1P78337 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITX1P78337 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PITX1P78337 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITX1P78337 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITX1P78337 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITX1P78337 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX1P78337 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PITX1P78337 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PITX1P78337 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PITX1P78337 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PITX1P78337 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITX1P78337 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITX1P78337 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITX1P78337 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITX1P78337 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITX1P78337 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITX1P78337 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX1P78337 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX1P78337 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITX1P78337 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITX1P78337 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PITX1P78337 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITX1P78337 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX1P78337 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX1P78337 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PITX1P78337 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX1P78337 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX1P78337 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms