Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HBG1P69891 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBG1P69891 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBG1P69891 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBG1P69891 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBG1P69891 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HBG1P69891 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBG1P69891 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBG1P69891 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBG1P69891 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBG1P69891 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBG1P69891 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HBG1P69891 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HBG1P69891 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBG1P69891 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBG1P69891 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBG1P69891 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBG1P69891 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBG1P69891 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBG1P69891 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HBG1P69891 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HBG1P69891 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBG1P69891 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBG1P69891 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBG1P69891 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBG1P69891 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBG1P69891 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HBG1P69891 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBG1P69891 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBG1P69891 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBG1P69891 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBG1P69891 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBG1P69891 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBG1P69891 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBG1P69891 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HBG1P69891 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms